กลุ่มงานวิเคราะห์อินทรีย์เคมี มีขอบข่ายภารกิจหน้าที่และความรับผิดชอบในการสถาปนาและพัฒนามาตรฐานการวัดแห่งชาติทางด้านอินทรีย์เคมี โดยการศึกษา ค้นคว้า วิเคราะห์ทดสอบด้านอินทรีย์เคมี ดำเนินโครงการวิจัยและพัฒนามาตรฐานอ้างอิง วัสดุอ้างอิง ที่ใช้วัดปริมาณสารอินทรีย์ในตัวกลางต่างๆ เพื่อให้วัสดุอ้างอิงมีความถูกต้องและเปรียบเทียบผลกันได้ตามมาตรฐานระหว่างประเทศ เพื่อให้ภาคอุตสาหกรรมและบริการของประเทศสามารถใช้อ้างอิงความถูกต้องของการวัดได้

กลุ่มงานวิเคราะห์อินทรีย์เคมีมีหน้าที่สนับสนุนและถ่ายทอดค่าวัดมาตรฐานแห่งชาติไปยังผู้ใช้งาน ผลิตวัสดุอ้างอิงรับรอง เข้าร่วมการเปรียบเทียบผลการวัดระหว่างประเทศ (Interlaboratory comparison) ให้ความรู้และคำปรึกษาเกี่ยวกับการวิเคราะห์ทดสอบทางด้านอินทรีย์เคมี ปฏิบัติงานร่วมกับกลุ่มงานอื่นในการพัฒนา กิจกรรมมาตรวิทยาระหว่างหน่วยงานทั้งในประเทศและต่างประเทศ ให้ความรู้และให้คำปรึกษาแก่ภาคอุตสาหกรรมและภาคบริการในการนำความรู้ด้านมาตรวิทยาไปใช้ในกระบวนการผลิตและทดสอบเพื่อยกระดับมาตรฐานการวัดของประเทศให้เป็นที่ยอมรับในระดับสากล อันจะเป็นการสนับสนุนการสร้างความสามารถในการแข่งขันทางการค้าของประเทศ ศึกษาติดตามวิทยาการ เทคโนโลยีและองค์ความรู้ใหม่ๆ ทางมาตรวิทยาเพื่อประยุกต์ใช้ในการพัฒนาระบบมาตรวิทยาของประเทศอยู่ตลอดเวลา

กลุ่มงานวิเคราะห์อินทรีย์เคมีประกอบด้วย 5 ห้องปฏิบัติการ

1. ห้องปฏิบัติการ High Purity Material
2. ห้องปฏิบัติการ Organic Standard Solution
3. ห้องปฏิบัติการ Trace Organic Compounds in Food
4. ห้องปฏิบัติการ Trace Organic Compounds in Clinical/Forensic
5. ห้องปฏิบัติการ Trace Organic Compounds in Environment